Les ennemis alliés, tels que ceux issus de Boule à Monstres, ajoutent des mouches au bocal, mais pas ceux issus d'autres ennemis.
Les batteries n'ont aucune incidence sur le nombre de mouches dans le bocal.
Les ennemis doivent être réellement « tués » pour ajouter une mouche. Les transformations (telles que les Béants se transformant en Errants) ou les effondrements (tels que neutraliser un Globin) ne comptent pas comme des éliminations.
Détruire un Gardien sera considéré comme une mise à mort.
Avec des objets qui tuent des ennemis normalement impossibles à tuer, tuer des créatures telles que les Grimaces de Pierre ajoutera des mouches au bocal.
Synergies
Livre des Vertus : Utiliser le Bocal de Mouches invoque des feux follets à la place des mouches bleues. Les feux follets n'invoquent pas les mouches lorsqu'ils sont détruits. Jusqu'à cinq mouches à la fois sont consommées pour invoquer un feu follet, avec une santé et des dégâts cumulables. Les dégâts des feux follets diminuent à mesure qu'ils subissent des dégâts. Les ennemis tués par les larmes des feux follets n'ajouteront pas de mouches au bocal.
Queue de Poisson : Double le nombre de mouches qui apparaissent.
Conscience Collective : Les mouches sont plus grosses et infligent deux fois plus de dégâts.
Cartable : Vous gagnez des mouches même lorsque le Bocal de Mouches est dans l'emplacement inactif.
Interactions
Cartes As : Les ennemis transformés en ressource ne donnent pas de mouches supplémentaires.
E. Coli / Chasse d'Eau : Les ennemis transformés en cacas ne donnent pas de mouches supplémentaires.
Néant : Les mouches ne sont pas collectées lorsque le bocal est absorbés par Néant, rendant l'interaction inutile.
Infestation 2 : Les araignées bleues générées par Infestation 2 ne donnent pas de mouches supplémentaires, et les mouches bleues générées par le Bocal de Mouches génèrent des araignées bleues.
Avec le Booster Pack#2, le sprite de cet objet se remplit de mouches supplémentaires en fonction du nombre de mouches qu'il contient. Ceci est basé sur ce mod du Workshop Steam créé par Stewartisme.
Belzébuth. Obtenir 3 objets de cet ensemble transforme Isaac en une mouche humanoïde géante.
Les ennemis 
Ennemis 
Le fouet de 
Boule à Monstres, ajoutent des mouches au bocal, mais pas ceux issus d'autres ennemis.
Béants se transformant en 
Errants) ou les effondrements (tels que neutraliser un 
Globin) ne comptent pas comme des éliminations.
Gardien sera considéré comme une mise à mort.
Grimaces de Pierre ajoutera des mouches au bocal.
Livre des Vertus : Utiliser le Bocal de Mouches invoque des feux follets à la place des mouches bleues. Les feux follets n'invoquent pas les mouches lorsqu'ils sont détruits. Jusqu'à cinq mouches à la fois sont consommées pour invoquer un feu follet, avec une santé et des dégâts cumulables. Les dégâts des feux follets diminuent à mesure qu'ils subissent des dégâts. Les ennemis tués par les larmes des feux follets n'ajouteront pas de mouches au bocal.
Queue de Poisson : Double le nombre de mouches qui apparaissent.
Conscience Collective : Les mouches sont plus grosses et infligent deux fois plus de dégâts.
Cartable : Vous gagnez des mouches même lorsque le Bocal de Mouches est dans l'emplacement inactif.
Batterie de Voiture : Aucun effet.
E. Coli / 
Chasse d'Eau : Les ennemis transformés en cacas ne donnent pas de mouches supplémentaires.
Néant : Les mouches ne sont pas collectées lorsque le bocal est absorbés par Néant, rendant l'interaction inutile.
Infestation 2 : Les araignées bleues générées par Infestation 2 ne donnent pas de mouches supplémentaires, et les mouches bleues générées par le Bocal de Mouches génèrent des araignées bleues.
Bug !
La synergie entre 
La Technique Ludovico et 
Soufre ou 
Technologie ne fera pas apparaître de mouches.
